В современных научных исследованиях биологического профиля все шире используются географические информационные системы (ГИС). Например, геоинформационные технологии успешно применяют при изучении закономерностей пространственно-временного распределения биологических объектов с учетом особенностей окружающей среды. Обычно ГИС используются для анализа текущих событий и/или прогноза будущих, но они также удобны для изучения ископаемых объектов, условий жизни в далеком прошлом, изменения биоразнообразия и выяснения исторических закономерностей эволюции биосферы.
Для палеонтологов разработали геоинформационную систему Удобство ГИС в комплексных палеонтологических исследованиях объясняется тем, что они совмещают функциональность систем управления базами данных, редакторов растровой и векторной графики и разнообразных аналитических средств.
За последние десятилетия палеонтологических исследований найдено очень большое количество окаменелостей, относящихся к множеству видов животных, растений, микроорганизмов. Для комплексного качественного анализа этой информации уже мало просто нарисовать на бумажной карте какое-то количество точек. Наибольшей эффективности анализа можно достичь путем создания базы данных и интеграции ее с ГИС. Но если еще не так давно каждый исследователь или отдельный научно-исследовательский институт старались делать свои собственные, как правило, небольшие базы данных, содержащие информацию, собранную только ими, то теперь актуальным представляется принципиально новый подход, автоматизирующий множество операций и объединяющий усилия множества ученых и научных коллективов из разных стран мира. Проекты, реализующие на практике такие подходы, уже существуют. Одним из них может считаться Paleobiology Database (Палеонтологическая база данных), в работе над которой принимали участие 350 специалистов из 133 институтов в 24 странах. На данный момент база содержит сведения более чем о миллионе находок остатков ископаемых организмов, является открытой и доступной для использования на основе лицензии Creative Commons.
Этот проект прямо на своем сайте предлагает возможность выборки информации по нескольким параметрам и визуализации ее на карте. Так как с помощью предлагаемого интерфейса нельзя указать для выборки множество дополнительных параметров, и к тому же многие исследователи хотят не только посмотреть на предлагаемой карте что-то, но и "потрогать руками" данные, нанести их на свои собственные карты и проанализировать своими инструментами, то Paleobiology Database предлагает удобный API (интерфейс программирования приложений).
Но очевидно, что далеко не каждый палеонтолог желает тратить свое время на то, чтобы разбираться в том, как запрограммировать выборку из базы данных и как затем нанести выбранное на географическую карту. Помощь в этом палеонтологам предлагает открытый ГИС-проект OpenWebGIS. C помощью этой онлайн-ГИС можно легко и быстро осуществить выборку из палеобиологической базы данных и одним кликом нанести результаты на карту. В качестве такой карты могут выступать Google Maps, OpenStreetMap или собственная векторная карта, если ее предварительно загрузить на сервер OpenWebGIS. Далее исследователь может сам настроить легенду отображения данных, произвести математический анализ из довольно широкого инструментария, предлагаемого в пункте меню "Вычисления" и получить наглядную картинку для сохранения на диске или печати, а также экспортировать результат в KML, GML, JSON, GPX для возможной работы в других ГИС системах.
В качестве примера анализа информации из палеонтологической базы данных с помощью OpenWebGIS можно рассмотреть карту, показывающую родовое разнообразие инфраотряда зауропод (Sauropoda) в виде пространственного распределения количества родов по 10 градусным квадратам. Данная карта получена путем нанесения на нее выборки с параметром "таксон" равным Sauropoda, без ограничения по временным периодам, с последующим приведением количества родов, встретившихся в каждом квадрате к его центру (пункт меню "Расчет по квадратам"), и построения тепловой карты (интерполяции) (пункт меню "Интерполяция") по этим величинам.
Аналогичным образом пользователи могут делать собственные выборки и автоматически наносить их на карту с помощью пункта меню OpenWebGIS "ГеоБазыДанных" -> "Палентологическая база данных". Подобное совместное использование онлайн палеобиологической базы данных и ГИС дает современному палеонтологу удобный инструмент для быстрого и нересурсоемкого (не надо устанавливать на свой компьютер никакого дополнительного программного обеспечения) анализа большого объема информации.
Источник: PaleoNews
12-10-2015 Просмотров:7404 Новости Генетики Антоненко Андрей
Ученые из университетов Юты и Аризоны (США), под руководством онколога-педиатра Джошуа Шиффмана (Joshua Schiffman) и эволюционного биолога Карло Мейли (Carlo Maley), разобрались, почему слоны так редко болеют раком. Оказывается, дело...
14-10-2012 Просмотров:13133 Новости Астрономии Антоненко Андрей
Планета 55 Рака e, «суперземля», расположенная в системе солнцеподобной звезды HD 75732 (она же 55 Рака, спектральный класс G8V), была открыта в 2004 году. Это одна из самых близких к...
13-05-2011 Просмотров:12295 Новости Зоологии Антоненко Андрей
При длительных подводных погружениях пингвины не тратят весь запасённый кислород. Вместо этого они переводят мускулатуру на особый, молочнокислый способ получения энергии, поэтому находящийся в крови и лёгких кислород достаётся другим...
25-01-2011 Просмотров:10803 Новости Зоологии Антоненко Андрей
Героическое животное провело в воде 232 часа, преодолев 687 км! Увы, на подобные подвиги морских млекопитающих вынуждает вовсе не г-н Мутко, а сокращение ледовых охотничьих угодий. Белые медведи отлично плавают, но...
18-05-2012 Просмотров:10029 Новости Генетики Антоненко Андрей
Исследователи обнаружили, что матричная РНК модифицирована ничуть не меньше, чем ДНК, причём модификации касаются важнейших генов, участвующих в развитии самых разных заболеваний, от рака до шизофрении. О том, что химические модификации...
Почти у всех живых существ есть биологические часы, регулирующие работу организма в зависимости от времени суток, и растения тут не исключение. В конце концов, для кого ещё, как не для…
Радиоуглеродный метод позволяет определить возраст органического материала — по сути, всего, что некогда было живым. В его основе — углерод-14, радиоактивный изотоп, который, в отличие от более стабильных форм углерода,…
Энтомологи Австралийского национального университета установили, что у муравьёв-бульдогов (bull ant) с Зелёного континента зрение эволюционировало согласно делению по обязанностям. Исследователи выяснили, что внутри одного вида муравьёв деление на роли в колонии…
Палеонтологи впервые нашли отпечатки тела и перьев новорожденного птенца, жившего на Земле 127 миллионов лет назад, что помогло им раскрыть некоторые тайны их эволюции, говорится в статье, опубликованной в журнале Nature Communications. Птенец птицы жившей…
Анализ первых образцов воды антарктического реликтового озера Восток показал, что они практически не содержат микроорганизмов, а значит, верхние слои воды в этом озере могут быть стерильны, сообщил Сергей Булат, заведующий…
Китайские ученые обнаружили в недрах своей страны остатки очередного тираннозаврида. Это длинномордое существо имело довольно своеобразный облик и отличалось от своего знаменитого родственника тираннозавра рекса не меньше, чем современный доберман-пинчер…
Необыкновенно сложный анализ костей пещерных львов показал, чтó эти существа ели и почему исчезли. Европейский пещерный лев (иллюстрация Jagroar)Термин «пещерный лев» не вполне корректен. Самые крупные представители семейства кошачьих своего времени…
Примерно 542 млн лет назад в геологической летописи появляется огромное количество животных с панцирем и скелетом. Они настолько разнообразны, что в специализированной литературе даже возникло такое понятие, как кембрийский взрыв. …
Некоторые исследователи берут на себя смелость утверждать, что и сегодня можно выделить ДНК динозавров, ведь никто не знает, сколько времени уходит на распад генетического материала... Одна из музейных реконструкций птицы моа…